Филтрите за микроскоп се използват за визуални наблюдения и за заснемане чрез цифрова камера. Комплектът MAGUS LF5 включва син, зелен и жълт цветни филтри, матов филтър и филтър за дневна светлина.
Филтрите със син, зелен и жълт цвят помагат за подобряване на цветовия баланс на изображението, увеличават контраста и яркостта и отстраняват оптичните изкривявания. Филтърът спира дадена дължина на вълната на светлината в зависимост от цвета, като позволява на другите дължини на вълната да преминат. Матовият цветен филтър се използва за получаване на разсеяна светлина. Филтърът за дневна светлина е необходим за коригиране на цвета при използване на микроскоп с халогенен източник на светлина. Светлината на халогенната лампа е „топла“, така че цветният филтър измества спектъра от жълтия диапазон към дневния диапазон, който е по-комфортен за очите.
Филтрите в комплекта MAGUS LF5 са предназначени за наблюдения с отразена светлина.